ระบบและกลไกการเงินและงบประมาณ วิทยาลัยฯดำเนินการได้ ๗ ข้อดังนี้
๑. มีแผนกลยุทธ์ทางการเงินที่สอดคล้องกับแผนกลยุทธ์ของสถาบัน โดยมีแผนกลยุทธ์ทางการเงิน ที่สอดคล้องกับแผนยุทธศาสตร์ของวิทยาลัยปี ๒๕๕๒-๒๕๕๔ (๘.๑-๑-๑) แผนยุทธศาสตร์ของวิทยาลัย ปีงบประมาณ ๒๕๕๑-๒๕๕๔ (๘.๑-๑-๒)
๒. มีแนวทางจัดหาทรัพยากรทางด้านการเงิน หลักเกณฑ์การจัดสรร และการวางแผนการใช้เงินอย่างมีประสิทธิภาพ โปร่งใส ตรวจสอบได้ โดยมีการกำหนดแนวทางการจัดหาทรัพยากรทางด้านการเงิน หลักเกณฑ์การจัดสรรงบประมาณ (๘.๑-๒-๑ ) และมีการวางแผนการใช้เงินงบประมาณด้วยความโปร่งใส สามารถตรวจสอบได้โดยมีคณะกรรมการตรวจสอบบัญชีฯ และคณะกรรมการติดตามงบประมาณ (๘.๑-๒-๒)
๓. มีงบประมาณประจำปีที่สอดคล้องกับแผนปฏิบัติการในแต่ละพันธกิจและการพัฒนาสถาบันและบุคลากร ปีงบประมาณ ๒๕๕๓ ได้แยกออกเป็น ๕ กลุ่มภารกิจ โดยมีการจัดสรรเงินตามกลุ่มภารกิจและในแต่ละพันธกิจของวิทยาลัยฯ (๘.๑-๓-๑) ซึ่งสอดคล้องกับแผนปฏิบัติการ ปีงบประมาณ ๒๕๕๓ (๘.๑-๓-๒)
๔. มีการจัดทำรายงานทางการเงินอย่างเป็นระบบ อย่างน้อยปีละ ๒ ครั้งโดย มีการจัดทำรายงานทางการเงินที่แสดงถึงสถานะทางการเงิน จำนวน ๔ ครั้งเพื่อนำเข้าที่ประชุมคณะกรรมการบริหารครั้งที่ ๑ (๘.๑-๔-๑) ครั้งที่๒ (๘.๑-๔-๒) ครั้งที่ ๓ (๘.๑-๔-๓) ครั้งที่ ๔ (๘.๑-๔-๔)
๕. มีการนำข้อมูลทางการเงินไปใช้ในการวิเคราะห์ค่าใช้จ่าย และวิเคราะห์สถานะทางการเงินและความมั่นคงขององค์การอย่างต่อเนื่อง โดยมีการนำรายงานของคณะกรรมการติดตามและประเมินผลงบประมาณ(๘.๑-๕-๑) และรายงานสรุปการใช้จ่ายเงิน มาวิเคราะห์เพื่อเสนอแนะและพยากรณ์รายรับรายจ่ายในอนาคต (๘.๑-๕-๒)
๖. หน่วยงานตรวจสอบภายในและภายนอก ทำหน้าที่ตรวจ ติดตามการใช้เงินให้เป็นไปตามระเบียบและกฎเกณฑ์ที่สถาบันกำหนด โดยมี ตรวจสอบภายในคือ คณะกรรมการตรวจสอบบัญชี กรรมการเก็บรักษาเงิน กรรมการรับจ่ายเงินฝากคลัง เงินฝากธนาคาร เงินงบประมาณ และเงินนอก(๘.๑-๖-๑) ผู้ตรวจสอบภายใน สำนักงานปลัดกระทรวงสาธารณสุข มาตรวจปีล่าสุด ๒๕๕๑ (๘.๑-๖-๒) และผู้ตรวจสอบภายนอก คือ สำนักงานตรวจเงินแผ่นดิน มาตรวจปีล่าสุด ๒๕๔๐ (๘.๑-๖-๓)
๗. ผู้บริหารระดับสูงมีการติดตามผลการใช้เงินให้เป็นไปตามเป้าหมาย และนำข้อมูลจากรายงานทางการเงินไปใช้ในการวางแผนและการตัดสินใจ โดยมีการจัดทำระบบฐานข้อมูลทางการเงิน ที่ผู้บริหารสามารถนำไปใช้ในการตัดสินใจ และวิเคราะห์สถานะทางการเงิน โดยใช้การรายงานจากฐานข้อมูลในระบบ GFMIS อิงรายงานสรุปรายการขอเบิกของวิทยาลัย รายงานแสดงยอดการเคลื่อนไหวของบัญชีเงินฝากคลัง รายงานแสดงรายละเอียดสถานการณ์เบิกจ่ายเงิน และรายงานสถานะงบประมาณ และนำผลการวิเคราะห์ค่าใช้จ่ายและสถานะทางการเงินเข้าประชุมกรรมการบริหารเพื่อติดตามผลการใช้เงินตามรายไตรมาสและพิจารณาหาแนวทางปรับปรุงแก้ไขในที่ประชุมคณะกรรมการบริหารวิทยาลัย (๘.๑-๗-๑, ๘.๑-๗-๒, ๘.๑-๗-๓, ๘.๑-๗-๔) 